Рубинка добавляет к физ атаке снаряжения, а значит на неё влияют модификаторы от силы/ловки, а также от скиллов, в т.ч. вспышки.
Для примера:
Вар, 350 силы, рубинка +100 атк
100атк +350% (мод. силы) = +450 итоговая физ атк (та что в статах).
1 вариант) Используем средний скилл: наносит базовый урон (450) +100% урона оружия (100) = +550 урона от рубинки.
2 вариант) Используем 3ци+автоатака: дает +500% от атк снаряжения: 100+500 = +600 урона от рубинки.
Яшма дает элемент. урон, на него модификаторы не действуют, т.е. +100-200 урона яшмы так и останутся. По этой причине рубинки почти всегда выгоднее, если только ваши противник не имеет физ защиту раз в 5+ больше, чем маг защиту.
Отдельная тема - возможное наличие в некоторых версиях багов, при которых химия/некоторые скиллы могут модифицировать этот элемент. урон.